課程資訊
課程名稱
遺傳流行病學原理
Principle of Genetic Epidemiology 
開課學期
105-1 
授課對象
公共衛生學院  流行病學與預防醫學研究所  
授課教師
陳為堅 
課號
EPM7138 
課程識別碼
849 M0330 
班次
 
學分
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期四3,4(10:20~12:10) 
上課地點
公衛212 
備註
與郭柏秀、林菀俞合開
總人數上限:45人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1051EPM7138_ 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本課程係以對數量遺傳分析有興趣之研究生為主要授課對象。課程內容以介紹各種常用之遺傳流行病學概念為主,解釋其涵義。開始時先介紹孟德爾遺傳定律、Hardy-Weinberg平衡、基因頻率的估計、聯鎖不平衡與半形頻率的估計、機率與遺傳危險性的計算等基礎概念。然後介紹幾種與基因定位有關的設計原理,包括聯鎖現象及其在基因拼圖上的應用、量性性狀的遺傳模式、再現率與基因型相對風險、Lod Score方法與聯鎖分析、基因體連鎖掃瞄、家庭為基礎之關聯分析。另外,有一些新的領域也做一些簡介,包含遺傳分析的貝氏統計、基因隨機漂流與歸宗、與基因表現量之分析等議題。至於這些概念在各種遺傳流病分析上的實際應用,不在本課程內教授;這些內容會在「基因體數量分析」中介紹。
 

課程目標
本課程的目標在於介紹關於質化與量化性狀遺傳分析的基本原理 ,讓學生瞭解如何透過遺傳分析蒐尋疾病的易感基因,以奠定他們進一步探討遺傳流病之文獻的基礎,有助於銜接其他之遺傳流行病學課程。 
課程要求
授課方式為課堂講授,並建議多種參考書。此外會分發補充讀物。成績評估包括:作業 (約5次, 50%) 和期末報告 (50%)。 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
另約時間 
指定閱讀
每次上課前,會將補充讀物置於課程網頁。 
參考書目
1. Griffiths AJF, Wessler SR, Lewontin RC, Carroll SB (2008): Introduction to
Genetic Analysis. 9th Ed. New York, W. H. Freeman and Company.
2. Thomas DC (2004): Statistical Methods in Genetic Epidemiology. New York:
Oxford University Press.
3. Hartl DL, Clark AG (2007): Principles of Population Genetics. Fourth Ed.
Sunderland, Massachusetts: Sinauer Associates.
4. 財團法人陳拱北預防醫學基金會(2015)。公共衛生學(修訂五版)。台北市: 國立臺灣大學出版中心。 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
作業 
50% 
約5次 
2. 
期末報告 
50% 
先在期末課堂上口頭報告,之後交書面報告 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2016/09/15  中秋節放假 
第2週
2016/09/22  a. 遺傳流行病學簡介
b. Video learning 
第3週
2016/09/29  a. Course introduction, overview of genetic epidemiology
b.Mendelian inheritance and its extensions/陳為堅  
第4週
2016/10/06  Hardy-Weinberg equilibrium and estimation of gene frequency/陳為堅  
第5週
2016/10/13  Linkage disequilibrium and estimation of haplotype frequency/陳為堅  
第6週
2016/10/20  Genetic risks and kinship coefficient/陳為堅 
第7週
2016/10/27  Genetic linkage, recombination fraction, and mapping function/陳為堅  
第8週
2016/11/03  a. Introduction of commonly used software:
FBAT & PLINK
b. 期末報告方式介紹及分組討論  
第9週
2016/11/10  Genetic model for quantitative traits/陳為堅 (期中考週) 
第10週
2016/11/17  Recurrence risk ratio and genotype relative risk/陳為堅  
第11週
2016/11/24  a. Linkage analysis for categorical trait
b. Linkage analysis for quantitative trait/陳為堅 
第12週
2016/12/01  Lecture: Genome-wide association study (GWAS) / 郭柏秀 
第13週
2016/12/08  Lecture: Transmission Disequilibrium Test (TDT) and Multimarker TDT /林菀俞 
第14週
2016/12/15  Random genetic drift /陳為堅 
第15週
2016/12/22  Analysis for gene expression levels and gene dosage effect/陳為堅 
第16週
2016/12/29  Lecture: Applications of Bioinformatics in Precision Medicine/陳璿宇 
第17週
2017/01/05  Students' Presentation (期末考)